一、南通市如東生態(tài)環(huán)境局設(shè)下列內(nèi)設(shè)機構(gòu)：

辦公室、綜合科、法規(guī)宣教科、水生態(tài)環(huán)境科（海洋生態(tài)環(huán)境科）、大氣環(huán)境科、土壤與固體廢物科（核與輻射安全管理科）、綜合執(zhí)法科、環(huán)境信訪調(diào)處科、生態(tài)環(huán)境應(yīng)急科（安全生產(chǎn)監(jiān)管科）、如東生態(tài)環(huán)境監(jiān)控中心、如東生態(tài)環(huán)境監(jiān)測站

二、南通市如東生態(tài)環(huán)境局設(shè)下列派出機構(gòu)：

南通市如東生態(tài)環(huán)境綜合行政執(zhí)法一局、

南通市如東生態(tài)環(huán)境綜合行政執(zhí)法二局、

南通市如東生態(tài)環(huán)境綜合行政執(zhí)法三局、

南通市如東生態(tài)環(huán)境綜合行政執(zhí)法四局、

南通市如東生態(tài)環(huán)境綜合行政執(zhí)法五局、

南通市如東生態(tài)環(huán)境綜合行政執(zhí)法六局。